MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 37973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013416	CCGT	2	8	54216	54223	0 %	25 %	25 %	50 %	261866785
1002	NC_013416	CAA	2	6	54257	54262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866785
1003	NC_013416	GCG	2	6	54271	54276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1004	NC_013416	A	7	7	54277	54283	100 %	0 %	0 %	0 %	261866785
1005	NC_013416	TGG	2	6	54284	54289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866785
1006	NC_013416	GCG	2	6	54448	54453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1007	NC_013416	GCGT	2	8	54525	54532	0 %	25 %	50 %	25 %	261866785
1008	NC_013416	ATG	2	6	54535	54540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1009	NC_013416	CCA	2	6	54542	54547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866785
1010	NC_013416	TTCT	2	8	54554	54561	0 %	75 %	0 %	25 %	261866785
1011	NC_013416	GTG	2	6	54601	54606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866785
1012	NC_013416	TAC	2	6	54616	54621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866785
1013	NC_013416	CG	3	6	54674	54679	0 %	0 %	50 %	50 %	261866785
1014	NC_013416	ACG	2	6	54758	54763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1015	NC_013416	AAC	2	6	54783	54788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866785
1016	NC_013416	TAC	2	6	54798	54803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866785
1017	NC_013416	GAT	2	6	54825	54830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1018	NC_013416	A	6	6	54877	54882	100 %	0 %	0 %	0 %	261866785
1019	NC_013416	TTAA	2	8	54895	54902	50 %	50 %	0 %	0 %	261866785
1020	NC_013416	TCG	2	6	54912	54917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1021	NC_013416	TCC	2	6	54994	54999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866785
1022	NC_013416	CGA	2	6	55008	55013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1023	NC_013416	GAA	2	6	55029	55034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1024	NC_013416	ATT	2	6	55042	55047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866785
1025	NC_013416	GCG	2	6	55051	55056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1026	NC_013416	GAA	3	9	55057	55065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1027	NC_013416	TGAT	2	8	55130	55137	25 %	50 %	25 %	0 %	261866785
1028	NC_013416	GGC	2	6	55143	55148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1029	NC_013416	ATG	2	6	55174	55179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1030	NC_013416	GAA	2	6	55195	55200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1031	NC_013416	ATG	2	6	55255	55260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1032	NC_013416	GCA	2	6	55285	55290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1033	NC_013416	CCG	2	6	55476	55481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866785
1034	NC_013416	ATC	2	6	55510	55515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866785
1035	NC_013416	TGA	2	6	55547	55552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1036	NC_013416	CGA	2	6	55572	55577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1037	NC_013416	GGC	2	6	55614	55619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1038	NC_013416	CTTG	2	8	55671	55678	0 %	50 %	25 %	25 %	261866785
1039	NC_013416	CGT	2	6	55737	55742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1040	NC_013416	GC	3	6	55795	55800	0 %	0 %	50 %	50 %	261866785
1041	NC_013416	GGT	2	6	55897	55902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866785
1042	NC_013416	AAC	2	6	55945	55950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866785
1043	NC_013416	AAC	2	6	55987	55992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866785
1044	NC_013416	AAG	2	6	56111	56116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1045	NC_013416	CGA	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866785
1046	NC_013416	TGA	2	6	56328	56333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1047	NC_013416	CGG	2	6	56490	56495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1048	NC_013416	CG	3	6	56501	56506	0 %	0 %	50 %	50 %	261866785
1049	NC_013416	ATTT	2	8	56513	56520	25 %	75 %	0 %	0 %	261866785
1050	NC_013416	GAA	2	6	56641	56646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1051	NC_013416	GCG	2	6	56699	56704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1052	NC_013416	AAGTGG	2	12	56918	56929	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	261866785
1053	NC_013416	CCG	2	6	56974	56979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866785
1054	NC_013416	ATT	2	6	56997	57002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866785
1055	NC_013416	CCT	2	6	57050	57055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866785
1056	NC_013416	ACC	2	6	57064	57069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866785
1057	NC_013416	GT	3	6	57071	57076	0 %	50 %	50 %	0 %	261866785
1058	NC_013416	GCG	2	6	57085	57090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1059	NC_013416	GAAA	2	8	57123	57130	75 %	0 %	25 %	0 %	261866785
1060	NC_013416	CGG	2	6	57155	57160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1061	NC_013416	CGG	3	9	57239	57247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866785
1062	NC_013416	GAA	3	9	57250	57258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1063	NC_013416	TGA	2	6	57275	57280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866785
1064	NC_013416	AGA	3	9	57327	57335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866785
1065	NC_013416	TTA	2	6	58111	58116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866786
1066	NC_013416	GAC	2	6	58176	58181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866786
1067	NC_013416	CTA	2	6	58194	58199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866786
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1069	NC_013416	CAA	2	6	58302	58307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866786
1070	NC_013416	ACA	2	6	58334	58339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866786
1071	NC_013416	TAC	2	6	58415	58420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866787
1072	NC_013416	TTG	2	6	58446	58451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866787
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1074	NC_013416	GCT	2	6	58611	58616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866788
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1080	NC_013416	CTTA	2	8	58985	58992	25 %	50 %	0 %	25 %	261866789
1081	NC_013416	CG	3	6	59003	59008	0 %	0 %	50 %	50 %	261866789
1082	NC_013416	GTT	3	9	59033	59041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866789
1083	NC_013416	CCA	2	6	59065	59070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866789
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1087	NC_013416	ATGT	2	8	59162	59169	25 %	50 %	25 %	0 %	261866789
1088	NC_013416	GCATT	2	10	59267	59276	20 %	40 %	20 %	20 %	261866789
1089	NC_013416	T	6	6	59286	59291	0 %	100 %	0 %	0 %	261866789
1090	NC_013416	ACG	2	6	59298	59303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866789
1091	NC_013416	ACG	2	6	59313	59318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866789
1092	NC_013416	T	6	6	59370	59375	0 %	100 %	0 %	0 %	261866789
1093	NC_013416	GGGC	2	8	59476	59483	0 %	0 %	75 %	25 %	261866789
1094	NC_013416	TG	3	6	59484	59489	0 %	50 %	50 %	0 %	261866789
1095	NC_013416	TTTA	2	8	59559	59566	25 %	75 %	0 %	0 %	261866789
1096	NC_013416	ATC	2	6	59839	59844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866790
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1098	NC_013416	T	6	6	59917	59922	0 %	100 %	0 %	0 %	261866790
1099	NC_013416	GTAA	2	8	59929	59936	50 %	25 %	25 %	0 %	261866790
1100	NC_013416	CTT	2	6	60056	60061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866791
1101	NC_013416	GCA	2	6	60075	60080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866791
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1104	NC_013416	ATT	2	6	60353	60358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866792
1105	NC_013416	ACG	3	9	60363	60371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866792
1106	NC_013416	AT	3	6	60376	60381	50 %	50 %	0 %	0 %	261866792
1107	NC_013416	CAC	3	9	60470	60478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866792
1108	NC_013416	GAT	2	6	60681	60686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866792
1109	NC_013416	AACC	2	8	60761	60768	50 %	0 %	0 %	50 %	261866792
1110	NC_013416	ACG	2	6	60870	60875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866792
1111	NC_013416	CAA	2	6	60941	60946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866792
1112	NC_013416	TTA	2	6	60964	60969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866792
1113	NC_013416	AGT	2	6	61023	61028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866792
1114	NC_013416	GTT	2	6	61041	61046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866792
1115	NC_013416	ACC	2	6	61050	61055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866792
1116	NC_013416	AAC	2	6	61116	61121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866792
1117	NC_013416	AAC	2	6	61125	61130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866792
1118	NC_013416	GAC	3	9	61133	61141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866792
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1120	NC_013416	CTT	2	6	61234	61239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866793
1121	NC_013416	T	6	6	61256	61261	0 %	100 %	0 %	0 %	261866793
1122	NC_013416	CAC	2	6	61288	61293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866793
1123	NC_013416	CAC	2	6	61313	61318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866793
1124	NC_013416	TTG	2	6	61438	61443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866793
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1126	NC_013416	TA	3	6	61605	61610	50 %	50 %	0 %	0 %	261866794
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1134	NC_013416	CTG	2	6	61989	61994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866794
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